Ein weiterer Bereich des neuen Hauptbahnhofes St. Pölten ist seiner Bestimmung übergeben: Der Personentunnel Ost, der den Zugangsweg vom Mühlweg aus mit der Parkpromenade verbindet. Für Pendler besonders vorteilhaft: Die Wegzeiten vom NÖ Landhaus auf die Bahnsteige etwa verkürzen sich um bis zu zehn Minuten.

Vom Personentunnel Ost gelangt man nach Fertigstellung des Bahnhofes auf alle drei Inselbahnsteige (2/3, 4/5 und 6/7). Somit ergibt sich neben der Passage im Haupteingangs-bereich im Osten des Bahnhofes eine wichtige Umsteigerelation für die Bahnkunden unter den bis zu 450 m langen Bahnsteigen.

Weiters kann man von den Bahnsteigen direkt in Richtung Südosten (Landhaus) sowie in Richtung Nordosten (Einkaufszentrum Interspar, Herzogenburger Straße, Landesklinkum St. Pölten) gelangen. Entlang des Zugangsweges Mühlweg wurden eine Reihe von Rad-abstellplätzen errichtet. Bürgermeister Mag. Matthias Stadler bei der Eröffnung: „In unmittelbarer Nähe ist dort auch die Haltestelle des LUP-Stadtbusses.“

Ab Mitte September 2009 wird der Stiegenabgang vom Bahnsteig 5 in den Personentunnel geöffnet. Dadurch ergibt sich für die Bahnkunden eine weitere Erleichterung beim Umsteigen bzw. Verlassen des Bahnhofes. „Mit November kann auch die Mariazellerbahn wieder bis in den Hauptbahnhof St. Pölten rollen“, bestätigte das ÖBB Baumanagement dem Bürgermeister.

Die Inbetriebnahme des Personentunnels war ursprünglich für das Frühjahr 2010 geplant. Aufgrund des ausgezeichneten Baufortschrittes kann der Tunnel 8 Monate früher eröffnet werden. Ing. Günter Dürrmoser vom ÖBB-Baumanagement: „Der Personentunnel ist auf der Ostseite mit einer roten Glaswand, die restlichen Wände sowie der Boden und die Stiegenaufgänge sind mit Granit verkleidet. Durch die großzügige Beleuchtung (Lichtdecke) ergibt sich ein angenehmes, freundliches Ambiente. Ein Blindenleit- und Wegeleitsystem sowie ein Fahrscheinautomat und Infovitrinen runden die Ausstattung ab.“